para criar uma pen de arranque do windows temos que formatar a pen com fat 32 com a flag de boot ativa.

nos isos mais recentes o ficheiro /sources/install.wim tem mais do que 4GB e terá que ser dividido. começamos por instalar o pacote wimtools:
sudo apt install wimtools

seguidamente copiamos o ficheiro /sources/install.wim do ponto de montagem para outra pasta e realizamos a sua divisão:
wimlib-imagex split install.wim install.swm 4000

como resultado obteremos dois ficheiros:

install.swm
install2.swm

abrimos um terminal na raiz da pen, criamos a pasta sources e o ficheiro sources/install.wim. o obletivo é que o ficheiro original sources/install.wim não seja copiado:
mkdir sources
touch sources/install.wim

finalmente copiamos os ficheiros resultantes da divisão para dentro da pasta sources.

https://doc.ubuntu-fr.org/tutoriel/installer_windows_boot_usb
https://orbitgadget.com/create-windows-10-bootable-usb-in-ubuntu/